Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rtl5Q5DTT4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtl5Q5DTT4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms