Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spsb3Q571F5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms