Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228bQ497Q6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228bQ497Q6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms