Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm10Q3UTQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm10Q3UTQ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm10Q3UTQ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm10Q3UTQ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms