Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtl4Q3URY0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtl4Q3URY0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtl4Q3URY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms