Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk3Q3U3Q1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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