Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TchpQ3TVW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TchpQ3TVW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms