Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrx1Q3TL44 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrx1Q3TL44 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms