Protein–RNA interactions for Protein: Q2PZL6

Fat4, Protocadherin Fat 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat4Q2PZL6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms