Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MitfQ08874 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MitfQ08874 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms