Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Siah2Q06986 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Siah2Q06986 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah2Q06986 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms