Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPINDOCQ05AH6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPINDOCQ05AH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPINDOCQ05AH6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms