Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp10Q000W5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp10Q000W5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms