Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
rp9P97762 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
rp9P97762 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
rp9P97762 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
rp9P97762 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
rp9P97762 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
rp9P97762 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
rp9P97762 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
rp9P97762 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
rp9P97762 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
rp9P97762 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
rp9P97762 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
rp9P97762 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
rp9P97762 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
rp9P97762 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
rp9P97762 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
rp9P97762 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
rp9P97762 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
rp9P97762 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
rp9P97762 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
rp9P97762 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
rp9P97762 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
rp9P97762 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms