Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bop1P97452 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bop1P97452 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bop1P97452 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bop1P97452 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms