Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1bP97358 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf1bP97358 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf1bP97358 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms