Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cux2P70298 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux2P70298 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux2P70298 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux2P70298 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cux2P70298 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cux2P70298 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cux2P70298 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cux2P70298 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cux2P70298 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cux2P70298 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cux2P70298 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux2P70298 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms