Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfn1P62962 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfn1P62962 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms