Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps11P62281 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps11P62281 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms