Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snap25P60879 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snap25P60879 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snap25P60879 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snap25P60879 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snap25P60879 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snap25P60879 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms