Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm2aP59997 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm2aP59997 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm2aP59997 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms