Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc4P54775 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc4P54775 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc4P54775 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms