Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CnbpP53996 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms