Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fgd1P52734 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms