Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Upp1P52624 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Upp1P52624 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Upp1P52624 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp1P52624 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upp1P52624 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upp1P52624 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms