Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl9P51670 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl9P51670 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms