Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod1P49813 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod1P49813 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms