Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd27P41272 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd27P41272 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd27P41272 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms