Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sftpa1P35242 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sftpa1P35242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms