Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa10P31310 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa10P31310 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms