Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc10P31257 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc10P31257 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc10P31257 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms