Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept4P28661 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept4P28661 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept4P28661 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept4P28661 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept4P28661 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept4P28661 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept4P28661 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept4P28661 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sept4P28661 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sept4P28661 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sept4P28661 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms