Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb9P28076 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb9P28076 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms