Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Xrcc6P23475 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xrcc6P23475 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc6P23475 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms