Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phka1P18826 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phka1P18826 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phka1P18826 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phka1P18826 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phka1P18826 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phka1P18826 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms