Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prf1P10820 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prf1P10820 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms