Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf3P05524 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf3P05524 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms