Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01783 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01783 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01783 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01783 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01783 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01783 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01783 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01783 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01783 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01783 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01783 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01783 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01783 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01783 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01783 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01783 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms