Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P01678 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P01678 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P01678 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P01678 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P01678 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P01678 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
P01678 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P01678 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P01678 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
P01678 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01678 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01678 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01678 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P01678 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
P01678 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms