Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx8O88983 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Stx8O88983 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx8O88983 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx8O88983 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms