Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Orc4O88708 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Orc4O88708 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms