Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp8O70138 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp8O70138 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp8O70138 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms