Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StrnO55106 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StrnO55106 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StrnO55106 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StrnO55106 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StrnO55106 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StrnO55106 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
StrnO55106 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
StrnO55106 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StrnO55106 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StrnO55106 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StrnO55106 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StrnO55106 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StrnO55106 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
StrnO55106 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StrnO55106 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StrnO55106 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StrnO55106 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StrnO55106 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms