Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb10O35955 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb10O35955 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms