Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CckarO08786 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CckarO08786 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CckarO08786 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CckarO08786 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CckarO08786 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CckarO08786 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CckarO08786 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CckarO08786 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CckarO08786 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CckarO08786 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CckarO08786 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CckarO08786 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CckarO08786 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms