Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efna3O08545 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efna3O08545 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efna3O08545 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efna3O08545 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna3O08545 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms