Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna4O08542 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna4O08542 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms