Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mfsd4b4J3QNS5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms