Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bbip1J3QMK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bbip1J3QMK2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms