Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5218F6YH22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5218F6YH22 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms